自2014年起，学校在航运学院设立轮机工程卓越工程师班，每年招一个教学班，学生规模30至35人。该班采用三年理论学习、一年集中实践的 “3＋1”和 “双导师制”的校企人才培养模式。

旨在培养符合“中华人民共和国船员教育和培训质量管理体系”标准，满足STCW国际公约和国家海事法规的要求，面向水上交通运输和船舶装备行业，培养轮机基础知识扎实、英语综合应用能力强、实践能力突出、工程素质良好，能胜任现代船舶装备的设计、建造、检验以及现代船舶轮机管理、维护与修理、机务管理、海事管理等工作的国际化、应用型高级轮机工程专业人才。