自2014年起，学校在航运学院设立航海技术专业卓越工程师班，每年招一个教学班，学生规模30至35人。该班以航海技术专业为主线，兼顾船舶管理、航海保障两个方向，实施三年理论学习、一年集中实践和“双导师制”的校企人才培养模式。

旨在培养符合“中华人民共和国船员教育和培训质量管理体系”标准，满足STCW国际公约和国家海事法规的要求，具有良好的远洋船舶驾驶和船舶管理能力，英语综合应用能力突出，熟悉远洋运输业务和海运管理的国际化、应用型高级航海技术专业人才。